Toernooifavoriet Scheffler, die de dag begon met een een gedeelde eerste plek met Homa en DeChambeau van LIV Golf, legde de eerste negen af in één-onder-par 35, wat hem op zeven-onder bracht.
Scheffler genoot van een perfecte start toen hij op de eerste hole een birdie sloeg en op de derde hole een 10-meter putt binnenrolde om een voorsprong van twee slagen op te bouwen voordat een bogey op de par-drie vierde hem wat wind uit de zeilen nam.
De nummer één van de wereld bracht het schip echter meteen weer recht en ging met een serie pars de bocht in, terwijl de toch al lastige greens van Augusta National steeds steviger en sneller werden.
Tweevoudig majorwinnaar Collin Morikawa, die één paar voor Scheffler speelde, begon met een trio aan birdies om de leider onder druk te zetten.
DeChambeau, één van de acht LIV Golf-spelers die de cut haalde en samen met Homa in de laatste pairing speelde, maakte een bogey op de par-vier derde om terug te vallen, maar reageerde met een korte birdie putt op de par-vijf achtste.
Homa, die in zijn vijfde Masters speelt, had een deel van de leiding kunnen pakken maar miste een 11-voet birdie putt op de achtste hole en moest genoegen nemen met een achtste par op rij.
Stralende zon
Een dag nadat slechts acht spelers par hadden gebroken in een tweede ronde die werd gespeeld te midden van windvlagen die de 40 mph overschreden en een moeilijke baan nog uitdagender maakten, werden de vroege starters begroet met een stralende zon en een veel lichtere bries.
Woods, die gisteren het record van 24 opeenvolgende geredde cuts op de Masters brak, begon zijn derde ronde met een achterstand van zeven slagen op de leiders en hoopte dat zijn door blessures geteisterde lichaam het zou houden en hem in staat zou stellen om vroeg in actie te komen.
Maar Woods, die deze week volhield dat hij nog steeds het record van zes Masters-titels van Jack Nicklaus kan evenaren, vertoonde plotseling tekenen van ongemak tijdens een afschuwelijke finish van zijn eerste negen en stond acht over na 15 holes.
Na een bogey met drie putten op de par-drie vierde putte Woods een vuistpomp veroorzakende birdie putt vanaf 19 voet op de vijfde die het grootste gebrul van de dag produceerde voordat hij plotseling begon te ontrafelen.
Woods ging bogey op de par-three zesde nadat zijn teeshot achter de green belandde, maakte een double-bogey op de zevende waar hij in een bunker chipte, sloeg nog een double op de achtste en een bogey op negen waar zijn approach nog een zandval vond.
McIlroy hoopvol
Onder de andere vroege starters was Rory McIlroy, die de dag begon met 10 slagen achterstand op de leiding en op zoek was naar een lage score om zijn hoop op het voltooien van de Grand Slam van de vier majors te vergroten.
"Het enige wat ik kan doen is hier komen en mijn best doen. Dat doe ik elke keer als ik hier ben. Sommige jaren gaat het beter dan andere," zei de nummer twee van de wereld McIlroy. "Ik moet gewoon blijven komen en proberen het juiste te doen."
De laagste score van de dag in het clubhuis kwam op naam van de Amerikaan Chris Kirk, die een vier-onder 68 noteerde en daarmee één over bereikte voor het toernooi.